Um gegen Belastungen in Gewässern anzugehen, testet der VSR die Qualität von Grundwasser in ganz Deutschland. Bei dem VSR-Gewässerschutz handelt es sich um eine Privatinitiative, die nach eigenen Angaben im Jahr 1980 "als Zusammenschluss verschiedener Bürgerinitiativen im Rheineinzugsgebiet" entstand, sich "für den Schutz des Grund- und Oberflächenwassers vor Verunreinigungen" einsetzt und um die Jahrtausendwende damit begann, ihre Tätigkeit auf das gesamte deutsche Nord- und Ostseeeinzugsgebiet auszuweiten. Die Abkürzung "VSR" blieb dabei noch als Hinweis auf den Ursprung der Umweltschutzorganisation bestehen, sie steht für "Verein zum Schutze des Rheins und seiner Nebenflüsse".