Zu den Akzenten, die er setzte, gehörten laut Bistum unter anderem sein Einsatz für Familien, Arbeitslose und Mütter in Not. Außerdem besiegelte er die Partnerschaft mit dem tansanischen Partnerbistum Mbinga. Mit dem „Museum am Dom“ in Würzburg habe der passionierte Klavierspieler und Kunstliebhaber 2003 „Europas größte kirchliche Sammlung zeitgenössischer Kunst“ eröffnet, so heißt es.

Bischof Scheele engagierte sich zudem unter anderem als Vorsitzender der Arbeitsgemeinschaft christlicher Kirchen in Deutschland oder bei der Ökumenereferent der Deutschen Bischofskonferenz. 1996 wurde er mit dem Verdienstkreuz 1. Klasse des Verdienstordens der Bundesrepublik Deutschland ausgezeichnet. 2003 wurde er als Bischof von Würzburg emeritiert.