In „The Last Alchemist” übernehmen die Spielenden die Rolle des letzten lebenden Alchemisten, der nach dem Tod seines Meisters in die verlassene Werkstatt zurückkehrt. In einer Welt, in der Wissenschaft und Magie miteinander verschmelzen, steht er vor der Aufgabe, ein Heilmittel gegen eine verheerende Seuche zu finden.